- 2017-01-12 16:26
- 作者:孙杨
- 来源:中国数字医疗网
精准医学在2011年由美国科学院、美国工程院、美国国立卫生研究院及美国科学委员会共同发起了“迈向精准医学”的倡议。随后在2015年中,被奥巴马正式推出“精准医学计划”。至此,精准医学正式走入了人们的视野,推动了个性化医疗的发展。同年,习近平总书记批示科技部和国家卫生计生委,要求成立中国精准医疗战略专家组,并首次召开了精准医学战略专家会议,会议提出了中国精准医疗计划,并指出,到2030年前,中国将在精准医疗领域投入600亿元。
2016年6月25日,国家科技管理信息系统公共服务平台发布《关于对国家重点研发计划“精准医学研究”2016年度项目安排进行公示的通知》,将61个精准医学方面的重点项目信息进行公示,这是我国确立精准医疗计划后,在精准医学科研领域项目落地的起步。
由此可见,精准医学这颗“种子”在中国这片肥沃的土壤中生根发芽。但随着科学技术的不断深挖和拓展,也引发了精准医学对IT技术提出了新的考验和要求。
“这是一个最好的时代,也是最坏的时代。”用狄更斯这句话来形容精准医学的现阶段最恰当不过。在国家政府的大力支持下,在医疗机构企业的全身心投入下,在对IT技术新考验下,精准医学将摸索前行。
IT技术迎来新挑战 让精准医学不再遥远
精准医学在我国肩负着“五项任务”,包括新一代的临床用生命组学技术的研发;大规模人群队列研究;精准医学大数据的资源整合、存储、利用与共享平台建设;疾病防诊治方案的精准化研究、精准医疗集成应用示范体系工程。
在面对大量数据的整合、存储、利用与共享中存在对IT技术提出了高性能、性价比、开放性的要求。
国家罕见病注册研究体系执行总监弓孟春博士曾表示,精准医学的研究过程对于数据采集、数据分析、数据挖掘一系列过程都具有严苛的要求,在这个过程不仅需要时间、资本,同样需要临床科研、基因测序、药品研发、IT等各个维度的力量共同推进。在面对高通量、大数据的分析时,对计算机计算资源的消耗上是非常高的。从实验室提取DNA,到最后得到分析结果,中间需要经历“建库-测序-比对/组装-变异检测-注释”等一系列实验和数据分析过程,第二代测序技术动辄单个样本就上T的数据量都会使得分析过程耗时耗资源。这其中的IT已经不再是简单承载数据的“容器”和“输送带”,更多需要的是具有“高计算”能力的IT支持。
不仅如此,复旦大学附属中山医院院长樊嘉教授介绍称,精准医学的本质,就是通过基因组、蛋白质组等组学技术以及一些医学前沿技术,针对大样本人群与特定疾病类型进行生物标记物的分析与验证,从而精确寻找到疾病的原因以及相应的治疗或预防的靶点,并对一种疾病的不同状态和过程进行精确亚分类,最终实现对于疾病和特定患者进行个性化精准治疗的目的。而这也是对IT提出了精准“计算能力”的要求。
计算能力不断升级 让“IT”学会精准
从上文我们可以看出,随着精准医学的探索研究、实践应用、临床科研,以及药品研发的不断前进,对IT提出了两大需求点,一是“高性能”,二是“高计算”。
为了让高大上的基因测序进入寻常百姓家,人类需要更加强大的高性能计算利器。IBM Power System S822LC为精准医学打开了“高性能计算”的大门,在当今的计算技术和科学方法要求每个处理器提供比以往更多的计算周期,并相应地实现极致的 I/O 性能。而IBM Power System S822LC能够极大加快基因组的分析速度。同时推动基因组学、生物医学成像和生物信息学不断实现快速突破。
而正是基于IBM Power System S822LC提供的高性能基础架构之上,让科学突破与临床数据不断整合,通过转化医学和个性化的治疗为人类实现更长的寿命和更健康的生活。
IBM不仅提供了针对高性能计算方面的产品,同时,还分别提供了用于大数据与云端的两大产品,一个是“大器有为”的IBM Power System S812LC,具有高扩展性和认知能力,能够洞察医疗大数据的深度含义。另一个是“大智若云”的IBM Power System S821LC,促进数据中心与云端连接的畅通,适应云环境下高密度高数据的吞吐量,在资源调配方面更加灵活。
可见,在精准医学对IT技术提出新考验和新要求的同时,IT也在不断与时俱进、更新升级,IT企业以满足医疗用户需求为己任,促进IT的精准化建设,更好地服务医疗的发展,提高医疗服务效率与质量。
IBM OpenPower LC支撑精准医学可持续发展
目前,精准医学的发展存在“价格昂贵”、“拓展性差”等瓶颈,而IBM OpenPower LC能够帮助精准医学在“性价比”和“开放性”两方面不断提升,支撑精准医学的可持续发展。
基于IBM OpenPower LC的DRAGEN 处理器将儿童全基因组测序数据分析时间从超过 22 个小时缩短至仅仅 41 分钟,进而将重症婴幼儿的病情诊断时间从 50 个小时缩短至 26 个小时。在高性能运算的同时,高性价比也成为快速推广精准医学的落地与实践的重要推手。同时,BM OpenPower LC提供的开放性平台为精准医学打开通往更广阔空间的大门。支撑精准医学发展的产品和解决方案将会在此平台上拥有无限扩展和延伸的机会。
随着精准医学不断的发展,更多“实力派”机构、专家的加入其中,凭借“高性能计算”、“高性价比”、“高开放性”的IBM OpenPower LC,我们迎来了精准医学的“井喷”时代。