医院信息系统覆盖范围涉及医院运营的各个环节，如临床医疗、行政管理、财务管理、知识管理、决策支持、患者服务、内外沟通、医保、双向转诊、外部接口等。同时，医院信息系统是随着信息技术自身的发展和医院的需求而逐步建设的，因此，在医院中存在着不同时期，不同厂家的子系统，服务于医院的不同需求。以下为目前医院信息系统的一般划分方式：

1）门急诊管理系统

◇ 门急诊挂号分系统

◇ 门急诊划价收费分系统

◇ 门急诊中西药房配发药

◇ 门诊部中心治疗室工作站

◇ 急诊科观察室护士工作站

◇ 急诊科观察室医生工作站

◇ 门诊医生工作站

◇ 结构化多媒体门急诊电子病历

◇ 分诊台、导诊排队系统

2）住院管理系统

◇ 住院出入转诊管理系统

◇ 住院收费管理系统

◇ 病房护理工作站

◇ 住院医生工作站

◇ 中心药房配发药管理系统

◇ 科室库存和管理系统

◇ 住院结构化电子病历系统