医院临床信息化建设是一项艰巨的长期任务，临床信息采集以及软件实施需要大量资金投入。通过临床信息系统应用，确实能够提升医院医疗质量，提高临床工作效率，但临床信息化建设的首要问题是如何评价系统投资成本以及收益效果。

上海交通大学附属第六人民医院郑西川等人在题为“临床电子医嘱CPOE对医疗质量的影响与投资效益研究 ”的文章中指出，临床电子医嘱(CPOE)实施实际上是医院临床信息设施和IT技术管理重组的过程，涉及医生、护士、临床组织架构以及领导力重新调整。CPOE应用与CDS的结合，能够极大地改进临床医疗质量，提升患者满意度。上海交通大学附属第六人民医院通过CPOE实施全面提升了患者医疗质量，通过临床决策支持系统初步应用，CPOE的潜力得到挖掘发挥，为临床医疗和成本控制提供了管理工具。在临床医疗方面，没有CPOE应用，许多药品不良事件并未在病历文档中记录，而通过CPOE可以避免造成患者精神和身体伤害的事件发生。研究发现，医院药物不良反应(ADEs)导致患者伤残赔付以及重复检查、重复化验花费的成本很大，保守估计通过CPOE应用可以至少降低10.4%的ADEs事件，同时CPOE提高了临床工作效率，约24～26个月可以收回CPOE实施和培训投资成本。

医院电子病历应用应重视CPOE系统实施，有条件的医院应全面实施医生临床医嘱，包括临床决策支持信息系统。CPOE实施需要各方协同工作，医学信息界应重视CPOE性能标准研究，以确保CPOE的有效使用，性能要求应包含对临床不良事件降低的要求。政府管理部门应鼓励医院开发实施适合自己要求的CPOE系统，并在资金投入上对CPOE开发、实施及相关流程改进提供支持。应继续关注改进患者医疗质量，降低医疗成本的信息技术，并适时对这些技术进行评估和支持。CPOE实施为医院和患者创造了双赢机会，通过减少药品不良反应事件，改进医疗质量，减低医疗成本，更加符合医疗卫生政策，同时实施CPOE系统也能在医疗质量和财务收益方面带来更多的好处。