内部困境

医联体的困境不仅来自外部。实际上，纵向整合资源的医疗联合体是对分级办医体制的一种突破。但不同层级的医疗机构发展水平差异很大，也存在不同的利益诉求，造成医联体内部也存在管理体制的问题。

湖北肿瘤医院肖燕、湖北省卫生厅副巡视员阮小明通过梳理湖北省医联体模式发现，由于存在医疗水平、人力资源、管理水平、服务水平以及经济水平发展不均的问题，不同机构之间的业务整合、信息标准，乃至文化理念等方面都存在冲突。

这些方面的冲突，很大程度上将会影响医联体的运转和作用的发挥。

上海瑞金医院的夏云、袁青、姜昌斌等通过对瑞金－卢湾医联体的调查发现，正是由于存在医疗水平、患者信任度、利益分配等方面的因素，医联体内部出现了双向转诊通道不畅的问题。

在这其中，利益的分配之间可能是医联体内部在制度建设上首先需要解决的问题。

蔡江南指出，对于医联体而言，尤其是内部各医疗机构还保持自主地位的医联体，必须建立起收益分享、风险分担机制，否则难以实现资源的整合。

无论是对医联体业务水平的整体提升，还是建立整个医联体的利益机制，实际上都指向如何建立医联体的治理机制。

对此，马晓伟提出在医疗联合体层面建立理事会等法人治理结构，从而既确保了政府作为公立医院所有者的责权，创新政府管理方式，又使集团相对独立于政府，具有充分的微观管理自主权，实现政事分开、管办分开。