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云计算如何与基因检测成为“黄金搭档”
  • 2015-10-21 15:03
  • 作者:史士云
  • 来源:医谷

随着基因产业的迅速发展,云计算正在成为基因公司的“宠儿”。越来越多的基因公司开始利用云计算平台的高吞吐能力降低海量基因、健康数据分析的成本。刚刚结束的国内规模最大的云计算行业峰会——2015云栖大会,便成为了基因公司争相展示创新能力的重要舞台。

深圳华大基因、北京聚道科技、一脉基因等多家基因公司都在此次大会上展示了最新的产品和技术,随着下一代基因测序、生物质谱和医学成像等医学技术的迅猛发展,大数据浪潮为生物医学带来了前所未有的机遇,将根本性的改变生物医学基础研究和医疗实践,但同时生物医学领域数据爆炸式的增长也对海量数据的存储和分析提出新的挑战。处理这些数据需要大量的计算资源、大规模的存储、高效的数据传输、安全稳定的运算环境,而云计算的出现则很好地解决了这些问题。

近年来,特别是今年以来,阿里云在基因领域频频发力,让业界侧目。业内专家介绍,阿里云强大的批量计算能力,为生物和医学领域带来了全新的基因数据分析体验。用户不再需要购买硬件,安装配置软件和掌握编程知识,可以从繁琐的IT设施和数据操作中解放开来,只需要专注科学本身。

阿里云高级专家林河山说:“结合阿里云对象存储,批量计算服务能够帮助生物信息分析专家在云上快速构建大规模基因组学应用。用户将更便捷、更简单、更迅速完成基因大数据计算,大大降低成本。同样,因为云计算的赋能,研究人员开展大规模的基因组学研究打开了“方便之门”,这将催生一批影响人类健康相关的变革性成果。”

谈及云计算给基因领域带来的变革影响,在此次云栖大会的基因专场分论坛上,聚道科技CEO李厦戎说道:“我们目前面向基因领域能够提供一套云计算方案,包括传输、存储、计算以及后续的分析。例如,我们的一个客户通过在全国范围内搜集各种各样的传染病原数据,判断某种传染病原由哪种致病微生物引起。这就需要数据处理能力能支持不同地区协同使用,一旦在某个地区发现感染人群,通过检验、基因测序就知道所感染的微生物种属。我们提供云端服务,帮助他们快速解读微生物的基因组信息,迅速采取对应方案,控制措施。在个人健康问题方面,大数据和云计算能有利于基因遗传性的分析,助力遗传病研究,预测后代患病几率,提供生育医学建议。”

人类的一套基因组包含30亿对碱基,能够编码功能蛋白的基因数量在3万左右,但这仅占整个基因组区域的3%,基因组上超过90%区域功能人类还是未知的。对于生命的解读不仅需要生命科学领域的不断创新,更需要计算领域的支持和参与。一脉基因创始人郝向稳表示:“十年前,业内开始搜集大量的人群数据,探究基因与疾病的关系,一旦了解某种病跟某种基因的关系,就可以从基因水平提高诊断的准确性,做到精准用药。此外,基因数据结合心率、血压、血糖甚至医学项目数据,才能正确地评判个体的健康状况。一脉基因的定位主要是做人的基因组数据分析、存储、解读,以及相关健康产品的开发。我们在做这个事情的过程当中,逐渐认识到利用云计算不仅可以前期减少投资,同时也避免购买服务器所产生的折旧损失。”

未来十年内大数据与人工智能将会改变几乎每一个行业,尤其是医疗,云计算与人工智能的结合将对基因数据进行更为深入的挖掘。对此,华大基因互联网发展中心总监官鑫做了进一步的解释:“基因及其研究,本身就与大众关系密切,而且需要巨大数据量才能解决问题、得到结果。当大数据和人工智能应用到基因行业时,能让基因行业从传统的实验科学走上一个快速突破的道路。现在我们对于很多复杂疾病的了解,包括人的表情与基因数据的关系,都需要很多的样本量去做验证,甚至需要机器学习完成。如果有这样的大数据技术和云计算,包括人工智能介入,可以做出很多成果和开发出很多产品。”

虽然基因测序已经开始影响并渗透我们的生活,但在大众的印象里,基因测序更多的还是倾向于“高大上”的健康消费,不是一般民众可以支付,那政府需要做一些什么工作来鼓励基因行业企业走向“大众化”。

李夏戎认为:政府目前能做的事情,是认真做好数据安全性的标准问题,在这个方面,美国做得比较好,其无论在医疗数据还是个人有关数据方面,都有一系列的标准保证它如何存储、传输,同时包括正确处理个人隐私方面的问题,而在我国,数据安全性还是一个比较模糊的概念,同时,每个人拥有两万多个基因,检测关注度会不一样,采用的技术、芯片也各不相同,因此目前基因检测也呈现良莠不齐的情况,由此导致了行业的混乱,并最终致使基因公司成本比较高,若我国能制定一套系统的数据安全行业标准,将有效促进企业成本的降低,从而使得基因测序将会成为大众的共享。

又快到一年一度全民狂欢的淘宝“双11”了,前段时间,医谷曾报道天猫医药馆联合聚划算同全国7大精子库推出捐精在线预约“聚划算”,一旦捐精成功,可以获得3000-5000元的捐精补助,此外还有各大精子库的的福利套餐,其中包括699元的亲子鉴定、199元的酒精代谢基因检测,如此实惠的基因检测引来了一大帮男筒子的热烈响应,华大基因、聚道科技、一脉基因也表示有想法在淘宝天猫进行推广产品,因为淘宝是非常好的电商推广渠道,但是不能把它当做唯一的销售渠道和终极的目的,且在流程服务方面也要非常谨慎,做到让基因检测既普及的同时又普惠了大众。

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