据行业人士反映港大深圳医院从初建到现在，深圳政府已经砸了35亿的资金，而余下几年，每年投入的金额显然都会以亿作为计量单位。而深圳三甲医院每年能从政府口袋里掏出来的钱，大约是每家1千万元。这就像是一个大家庭里忽然添了个小儿子，占尽父母宠爱不说，零花钱还是其他几个哥哥的数倍。就算是再宽和的兄弟，心里也会埋怨父母的偏心吧。

港大深圳医院现在能顺利办下去，无非是背后有政府资金撑腰，等到五年之后政府断供，看看怎么收场。事实上，目前的投入在港大深圳医院看来，其实并不算多。香港政府年初透露，在2012至2013财年，港府将向医管局提供约411亿港元的拨款，这笔钱将用于公立医院的开支。广东省卫生厅副厅长廖新波坦言，虽然深圳过去10年在医疗领域上的投入在全国已经是佼佼者了，但还只相当于香港一年半的投入。

一家三甲医院负责人曾经私下吐槽，认为如果政府将给港大深圳医院的拨款给深圳任何一家医院，效果都不会比现在差。而曾经参与港大深圳医院筹建的一位内地人士透露，该院和深圳市其他医院最大的区别是医院的钱被用到什么地方。“香港人的操作模式是将八成的收入用于人工支出，而内地医院则是将大部分收入用来购买医疗器械”。前者保证医护人员的廉洁，而后者则主要是保证医院还有源源不断的收入，业内人都心照不宣的一个事实就是：检查收入早已取代药费，成为医院收入的大头。

但这并不意味着港大深圳医院就能十全十美了，事实上，它所沿袭的香港模式并非完美，也有等待时间太长等不足。港大深圳医院目前还在试运营阶段，还有相当多的矛盾没有凸显出来。首先，预约的模式能否满足深圳如此紧张的需求，按照目前的看诊规模，恐怕难以承担公共医疗职责。其次，它的后续运营资金如何解决，特殊医疗是否能反哺基础医疗。还有一点值得注意的是，一位担任医院管理层的人士透露，目前港方和内地方在医院管理上并不是没有分歧，“他们(港方)往往开一天会讨论很久都做不出决定，而我们更习惯领导直接拍板”，他表示，香港人在规则上的“死脑筋”，让内地人觉得，效率实在太低，干不成事儿。

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