信息录入和网络建设是做好新型农村合作医疗工作的重点。为准确录入信息，旗合管办组织乡（镇）合管办专干进行培训，对参合农民的基本信息进行准确录入，对参合人数、个人信息等进行现场核对，保证了录入信息的准确性；该旗全面启动合作医疗信息管理系统，实现了网络资源共享，通过日常事务子系统、综合查询子系统、系统维护子系统三大模块，对合作医疗整个流程进行信息化管理，实现了合作医疗管理系统与部分定点医院管理系统对接；阿旗合管办先后多次举办新型农村合作医疗信息管理系统业务培训班，对合管办所有工作人员进行计算机应用操作培训，有效提高了工作人员的操作技能、业务素质和工作水平。

开通了信息查询通道，在旗合管办“一站式”服务大厅设立了查询平台，参合农牧民可通过触摸式网络平台，随时查询就医及报销情况，了解相关年度合作医疗政策，及时向旗合管办反映就医过程中存在的问题。

通过加强新型农村合作医疗信息化建设，提高了工作效率，降低了管理成本，做到了实时监控，保障了资金安全。阿旗合管办通过合作医疗网络系统实时监控定点医疗机构诊疗服务行为，实时从网上审查参合患者住院资料、用药情况、费用清单、住院补助等，发现有违规现象立即责令定点医疗机构进行改正，变事后监督为事前防范和事中监督。

同时，由于实行了信息化管理，参合农民报销时补偿费用由计算机自动生成，有效堵住传统方式的漏洞，使资金的管理、使用、审核、报销等更加合理安全，从而杜绝了暗箱操作的行为，增强了工作透明度。阿旗合管办还通过合作医疗网站平台及时发布有关信息，对医疗服务质量有关指标进行统计分析，为政府科学决策提供及时、准确的依据，信息化建设让阿旗新型农村合作医疗步入了健康的发展轨道。