在国内，临床信息系统还处在起步和发展阶段，就是目前的几个典型应用也还仅在少数信息化建设比较好的医院得到推广应用。总体上，医院临床信息系统有以下几个主要发展方向。

独具特色的专业化系统

在我国，临床信息系统目前还刚处于起步阶段，因此开发的软件还不够精，还不能适应各特色专科的要求。因为医疗各专科既有共性，也有很大的区别。如门诊医生站，急诊与内分泌科就有很大的区别，生殖助孕中心更有特殊的要求。但目前软件还很难适应这些特殊科室的需求。因此下一步临床信息系统一定是在满足共性的前提下，发展各有特色的专用软件，如血透、生殖助孕、介入治疗等信息系统。

信息系统集成平台

由于软件开发的越来越专业化，像过去那样由一个厂家单打独斗的情况会越来越少。根据医院的实际需要，整合不同厂商有特色的专业系统从而形成统一的大系统是临床信息系统的发展趋势。而要把这么多系统进行有机的整合难度是非常大的，特别是在我国卫生信息标准化程度比较低的情况下难度更大。而集成平台无疑是实现系统整合的一个非常有效的手段，如果医院能够通过集成平台实现与各信息系统的有效集成，那医院无疑掌握了信息系统发展的主动权。

门诊医生工作站 具有完整临床信息的电子病历

在临床意义上，电子病历不仅是一个记录本，还是一个信息高度集成的系统，电子病历的实现实质上是医院医疗工作的全面信息化，是整个医疗卫生行业的全面信息化]。因此，它的实现是是一个长期的发展过程，尤其是它的发展很大程度上也依赖临床信息系统的发展。临床信息系统是电子病历的的直接信息源。临床信息系统涉及到医生、护士和检查科室等与病人医疗相关的各个环节，包括医嘱处理、病程记录、检验、医学影像、监护和麻醉等多个不同的系统。这些系统在帮助医护人员完成业务工作的同时，充当病人信息收集者的角色。因此电子病历建设需要完善的临床信息系统作为基础，而临床信息系统发展的最高阶段是实现具有完整临床信息的电子病历。